Argonaute es una familia de proteínas que se asocian con pequeños ARN interferentes y confieren silenciamiento génico.

Las proteínas argonauticas son componentes catalíticos del complejo RISC en el origen del fenómeno de silenciamiento o interferencia por ARN. Pueden unirse a diferentes clases de pequeños ARN no codificantes, en particular microARN (miARN), ARN interferente (ARNi) y ARN que interactúa con Piwi (ARNi). Los ARN pequeños guían a las proteínas argonautas a su objetivo específico por complementariedad de secuencia, lo que generalmente permite el silenciamiento del objetivo. Ciertas proteínas Argonautas tienen una actividad endonucleasa dirigida hacia las cadenas de ARN mensajero (ARNm) que tienen una buena complementariedad con el ARN pequeño al que están unidas (actividad "cortadora"). Estas proteínas también participan en la selección de la cadena guía y en la destrucción de la cadena transitoria (ver la sección de interferencia por principios de ARN).

La base estructural del enlace ARN-Argonauta ha sido estudiada por cristalografía de rayos X del dominio de unión de una proteína Argonauta unida a su ARN. El extremo 5 'fosforilado de la cadena de ARN ingresa en una bolsa de superficie preservada y básica, y el contacto se realiza mediante un catión divalente como el magnesio y mediante un "apilamiento" aromático (enlace pi-pi no covalente) entre nucleótido 5 'de ARNi y un residuo de tirosina conservado de Argonaute. Se cree que este sitio forma un centro de nucleación para la unión de ARNi a su ARNm objetivo.

En eucariotas, se han encontrado proteínas de argonautas en altas concentraciones en regiones del citoplasma celular llamadas "cuerpos P" donde también se localizan las enzimas involucradas en la vía de degradación del ARNm. La familia de proteínas Argonautes no solo existe en eucariotas sino que es compartida por arqueas y ciertas bacterias como Aquifex aeolicus. Los estudios basados en la genómica comparativa sostienen que la familia Argonaut evolucionó a partir de componentes del sistema de iniciación de la traducción, debido a su homología con el factor de iniciación eucariota eIF2.

Las proteínas argonautas llevan el nombre del fenotipo AGO argonauta de los mutantes de Arabidopsis thaliana, que se denominan a sí mismos debido a su parecido con los argonautas.

La secuenciación de alto rendimiento mediante inmunoprecipitación de argonauta se ha utilizado como un método para identificar microARN diana: los microARN vinculados tanto a Argonauta como a su ARN mensajero objetivo podrán precipitarse y secuenciarse.

Leer más